黄少祺从小由母亲一手扶养长大,幼时住在巷弄中的一间旧房子中,回家前经过长廊时,都会被蟑螂吓到。黄少祺大学就读于文化大学印刷摄影系；大二时,黄少祺在SOGO忠孝馆时被广告公司发掘,从而进入模特圈。
黄少祺生活照1997年,黄少祺与女艺人吕旻蓁交往。2009年,交往12年的他们于美国登记。2011年,二人在中国台湾注册结婚。2012年6月,黄少祺与吕旻蓁的大儿子Jeremy诞生。2013年8月5日,瞒婚4年的黄少祺承认已婚,并表示之前他与妻子重隐私,才没有公开情事。2015年7月27日,黄少祺与吕旻蓁的二胎儿子诞生。黄少祺私底下是一个有洁癖的人,家里摆设整齐,环境一尘不染,甚至连日用品的摆设都像超市一样的整齐。黄少祺一直维持运动习惯,每天跑10公里,且要在50分钟跑完,重量训练40分钟,伏地挺身500至1000下,运动已是生活一部分。
2009年9月出席在龙口市举办的“台湾8.8水灾爱心义演晚会”及“第七届芭莎明星慈善夜”。